小兒外科專業成立于1999年3月，病房設在普外科，莊會文副主任，時有副主任醫生1人，主治醫師1人，住院醫師1人。

2005年10月，小兒外科獨立建科，莊會文任主任，有主任醫師2人，副主任醫師2人，主治醫師4人，住院醫師2人。

1、 腹腔鏡治療小兒腹股溝斜疝、精索鞘膜積液、精索靜脈曲張、闌尾炎、先天性肥厚性幽門狹窄等病。 2、 先天性胃腸道畸形的診治。 3、 小兒急腹癥如闌尾炎、腸梗阻、腸套疊的診治。 4、 小兒創傷如內臟破裂的診治與搶救。 5、 先天性巨結腸的手術治療。 6、 小兒泌尿系疾病的微創診治。 7、 小兒四肢骨折的微創治療。 8、 先天性馬蹄內翻足的矯治。 9、 先天性髖關節脫位的早期論斷及治療 10、 腦癱的手術治療及康復。 11、 小兒良惡性骨腫瘤的診治。 12、 小兒外科疑難病癥的診治。